Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEFVO15553 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEFVO15553 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEFVO15553 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEFVO15553 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEFVO15553 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEFVO15553 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEFVO15553 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEFVO15553 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms