Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC5O15511 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARPC5O15511 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms