Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD3EAPO15446 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD3EAPO15446 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms