Protein–RNA interactions for Protein: O15427

SLC16A3, Monocarboxylate transporter 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3O15427 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC16A3O15427 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC16A3O15427 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC16A3O15427 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms