Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SYNJ2O15056 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ2O15056 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms