Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPEO14579 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPEO14579 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPEO14579 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPEO14579 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPEO14579 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPEO14579 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPEO14579 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPEO14579 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPEO14579 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPEO14579 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPEO14579 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPEO14579 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPEO14579 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPEO14579 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms