Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CITO14578 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CITO14578 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CITO14578 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CITO14578 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CITO14578 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CITO14578 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CITO14578 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CITO14578 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CITO14578 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CITO14578 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CITO14578 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CITO14578 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms