Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRTO14522 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRTO14522 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRTO14522 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
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