Protein–RNA interactions for Protein: O00444

PLK4, Serine/threonine-protein kinase PLK4, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLK4O00444 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLK4O00444 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLK4O00444 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLK4O00444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLK4O00444 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLK4O00444 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLK4O00444 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLK4O00444 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLK4O00444 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLK4O00444 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLK4O00444 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLK4O00444 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLK4O00444 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLK4O00444 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLK4O00444 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLK4O00444 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms