Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3B1O00203 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B1O00203 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms