Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMAPO00193 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAPO00193 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAPO00193 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAPO00193 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAPO00193 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAPO00193 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAPO00193 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAPO00193 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAPO00193 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms