Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
J3QR89 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
J3QR89 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
J3QR89 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3QR89 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3QR89 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QR89 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3QR89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3QR89 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms