Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
J3KR12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
J3KR12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
J3KR12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
J3KR12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3KR12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3KR12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3KR12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
J3KR12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3KR12 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms