Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
I3L3M4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
I3L3M4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
I3L3M4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
I3L3M4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
I3L3M4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
I3L3M4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
I3L3M4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms