Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C1W4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C1W4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1W4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1W4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1W4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1W4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C1W4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C1W4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C1W4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
H7C1W4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C1W4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1W4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1W4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1W4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C1W4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
H7C1W4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
H7C1W4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C1W4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H7C1W4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C1W4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C1W4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C1W4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms