Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
E9PCH4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
E9PCH4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
E9PCH4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E9PCH4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E9PCH4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E9PCH4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E9PCH4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
E9PCH4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
E9PCH4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
E9PCH4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
E9PCH4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
E9PCH4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
E9PCH4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
E9PCH4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
E9PCH4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
E9PCH4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
E9PCH4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
E9PCH4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
E9PCH4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
E9PCH4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
E9PCH4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
E9PCH4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
E9PCH4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
E9PCH4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
E9PCH4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
E9PCH4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
E9PCH4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
E9PCH4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms