Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TISP43B9A030 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TISP43B9A030 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms