Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DLN1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DLN1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DLN1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4DLN1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4DLN1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4DLN1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4DLN1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4DLN1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4DLN1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B4DLN1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
B4DLN1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
B4DLN1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
B4DLN1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
B4DLN1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B4DLN1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4DLN1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4DLN1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
B4DLN1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
B4DLN1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms