Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms