Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPBD1B2RD01 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms