Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HACD1B0YJ81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD1B0YJ81 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms