Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEURL1BA8MQ27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEURL1BA8MQ27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms