Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNZ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNZ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NNZ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NNZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NNZ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NNZ2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NNZ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NNZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NNZ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NNZ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NNZ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NNZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A6NNZ2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A6NNZ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms