Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRRM3A6NNA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRRM3A6NNA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms