Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM23A6NLE4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM23A6NLE4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM23A6NLE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms