Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC69A6NI79 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC69A6NI79 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms