Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms