Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSDA5PKW4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSDA5PKW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms