Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTAGE9A4FU28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTAGE9A4FU28 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTAGE9A4FU28 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms