Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPED1A4D0V7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPED1A4D0V7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms