Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms