Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM72A0PK05 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM72A0PK05 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms