Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GAPVD1Q14C86 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RPSAP46-201ENST00000428316 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms