Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms