Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms