Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGAP9Q5VTM2 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms