Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NBR1Q14596 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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