Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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