Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP35Q9P2H5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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