Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SGCZQ96LD1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SGCZQ96LD1 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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