Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PTPRJQ12913 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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