Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms