Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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