Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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