Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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