Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CAPZA3Q96KX2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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