Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NBR1Q14596 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms