Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PTPRJQ12913 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTPRJQ12913 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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