Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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