Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TM2D2Q9BX73 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms